تختلف البرامج الدراسية المقدمة في جامعة نيشانتاشي باختلاف التخصصات التي تقدمها الكليات. هناك أكثر من 54 برنامجًا متاحًا لطلاب المرحلة الجامعية من خلال 6 كليات رئيسية:

• كلية الطب
• كلية طب الأسنان
• كلية الهندسة والعمارة
• كلية الاقتصاد والعلوم الإدارية والاجتماعية
• كلية الفنون والتصميم
• كلية العلوم الصحية

بالإضافة إلى برامج البكالوريوس، تقدم جامعة نيشانتاشي أيضًا العشرات من برامج الدبلوم المعتمدة من خلال مدارسها المهنية، بما في ذلك كلية التربية البدنية والرياضة، وكلية الطيران المدني، وكلية العلوم التطبيقية، وكلية الخدمات الصحية، والمعهد الموسيقي. علاوة على ذلك، يوفر معهد الدراسات العليا برامج الماجستير والدكتوراه المتخصصة للطلاب الذين يسعون إلى مواصلة تعليمهم.